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第七届磁共振脑网络数据处理班

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发表于 2018-11-7 21:41:13 | 显示全部楼层 |阅读模式

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第七届磁共振脑网络数据处理班

思影科技将于2018年12月30日-- 2019年1月4日(周日-下周五)举办第七届磁共振脑网络数据处理班(详见课表安排)。
1、培训简介
大脑任何区域都不是孤立的,它们之间总产生信息交互。脑网络是描述这种信息交互的主要模型。人脑以网络形式存在和工作,研究脑网络,重点在于描绘大脑网络连接模式,运用多模态数据(结构、功能等)揭示其内在规律,为认知、发育和脑疾病的研究提供新见解。
脑网络的连接模式主要从多模态磁共振脑影像数据中获取,并在基于图论的复杂网络分析框架下加以解析。然而,此过程涉及繁复的图像预处理、众多的网络参数设置、复杂统计比较等,从而使得很多研究者在开展脑连接组学研究时面临很高的学习成本。
针对这种情况,思影科技的脑网络数据处理课程将从脑功能网络构建分析开始,紧接着着手培训结构网络构建分析,功能和结构并驾齐驱,并辅以脑影像机器学习与ICA相关内容。课程囊括了当前主流的脑网络分析方法。在功能上采用神经影像脑连接组分析软件—GRETNA进行手把手教学,在结构网络上采用DTI追踪构建脑网络并加以分析,并引入当前国际最前沿的动态脑网络分析。希望能够给参与者在磁共振脑网络数据处理上带来帮助与进步。
2、培训对象
参加脑网络数据处理班的学员需要具有一定的功能磁共振及DTI脑影像的基础,希望本次脑网络数据处理班的举办,可以进一步提高参与者的磁共振神经影像数据处理能力。
思影科技一直坚持小班教学的方式,并配备教辅人员,后续提供在线支持,及时解决学员数据处理中存在的问题。
培训内容主要包括:功能连接分析及弥散张量成像基础,网络构建基础及结构、功能网络构建与分析,GRETNA讲解和上机操作,动态脑网络分析,FSL MELODIC ICA分析,PANDA讲解及上机操作,脑影像机器学习介绍与PRoNTo实战等。
注:如方便,请于会议开始前一天到达会场(9:00 - 20:00)或第一天早晨8点30分到达会场,熟悉场地及安装软件、拷贝资料等事宜。
3、课程安排
时间
课程名
主要内容
第一天
12月30日
杨田雨
上午
基于多模态磁共振影像的人脑连接组学
  • 人脑连接组学简介
  • 结构网络、功能网络构建简介
  • 网络拓扑属性简介
下午
脑网络数据处理相关的MATLAB等技能
  • MATLAB基本数据结构
  • 脑网络相关的MATLAB技能
  • 静息态fMRI数据处理基础
晚上
脑影像数据处理相关的LINUX基础
  • Linux基础及指令介绍
第二天
12月31日
李伟凯

上午
脑网络构建和分析
  • GRETNA:
  • 静息态fMRI数据处理
  • 静态网络构建

下午
GRETNA讲解和上机操作(一)
  • GRETNA:
  • 网络属性介绍,网络拓扑分析


第三天
1月1日
杨田雨
上午
网络属性统计
  • 脑网络统计原理简介
  • GRETNA统计模块介绍
下午
    统计结果可视化
  • GRETNA可视化模块
  • MATLAB作图
  • BrainNet Viewer介绍

晚上

脑影像机器学习与实战
  • 机器学习简介
  • 分类、回归、交叉验证等
  • MVPA、SVM简介
  • PRoNTo影像模式识别工具包实战
第四天
1月2日
仲苏玉
上午


脑白质网络构建和分析

  • 基于DTI数据的人脑连接组学的方法学
  • 基于DTI数据的人脑连接组学的应用研究现状
  • PANDA基本原理介绍
下午
  • 脑白质网络连接组分析软件PANDA实例及上机操作

晚上


脑白质网络拓扑分析及统计分析
  • 脑白质网络拓扑分析流程及上机操作
  • 脑白质网络拓扑属性的统计分析
第五天
1月3日
龙治良
上午
ICA原理和ICA去噪声
  • ICA基本原理介绍
  • 数据准备和预处理
  • 用ICA进行数据去噪
下午
ICA成分判别和结果统计
  • 用MELODIC运行ICA
  • ICA成分识别
  • ICA结果统计
  • 用命令行运行MELODIC
晚上
内容回顾与复习
  • 复习与答疑


第六天
1月4日
吴国榕
上午
动态脑网络构建和分析
  • 动态脑功能网络分析简介
  • 血液动力学去卷积
下午
基于DynamicBC的动态功能连接讲解和操作
  • DynamicBC构建时变脑功能网络(基于滑动窗和FLS方法)
  • 动态脑网络拓扑分析和统计

4、培训人数
为保证培训质量,此次培训限定人数20人左右,报名敬请从速。
5、培训地点
南京市秦淮区中山南路315号瑞华大厦2404,具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员3500/人(含资料费、培训费,交通及食宿费自理)。
7、报名方式
请将报名回执发送至:syfmri@163.com,我们会第一时间联系您。
8、缴费方式
银行转账或者支付宝(18580429226,户名:杨晓飞),谢绝录像,主办方提供发票。
9、联系方式
联系人:杨晓飞。
电话:18580429226。
10、备注
请各位培训学员自带笔记本电脑(Windows 64位系统、i5、4G内存以上、50G剩余存储空间等基本配置;苹果Mac电脑用户如方便请提前使用Bootcamp加装Windows 64位系统);学员自己有数据的可以带3-5例进行现场处理;报名请先将回执表发至syfmri@163.com并在12月10日前进行缴费,便于培训安排。
报名回执表
单位名称、税号
(发票抬头)

姓名

性别

QQ

电话号码

科室/专业

缴费方式
□转帐  □支付宝 (请选择在□打√)
银行信息
户名:南京思影科技有限公司
账号:125909558210401
开户银行:招商银行股份有限公司南京中山南路支行
汇款备注
第七届磁共振脑网络数据处理班
注:请完整填写回执表后回传给我们,以便给你发送确认函,谢谢支持!
11、在线支持服务
思影科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持与合作,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理方法。
  •         12.培训人员简介:
吴国榕,博士,西南大学心理学部副研究员。主要研究方向是基于神经影像数据的动态脑功能活动和脑连接分析算法开发。相关文章发表在Medical Image Analysis,Brain Stimulation等学术期刊上。开发了Brain GPS,NICE和DynamicBC等数据分析软件。目前,主持一项国自然青年项目,参与多项国自然面上和重点项目。
仲苏玉,博士,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室博士后。2016年6月于北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室获得博士学位。目前主持国家自然科学基金青年项目1项,博士后面上项目1项,并作为主要参与人参与多项国家自然科学基金项目。目前主要从事基于弥散磁共振成像的人脑白质连接组学的方法学及其应用研究。目前已在相关领域国际权威期刊共发表SCI论文13篇,其中包括以第一作者身份在Cerebral Cortex, Human Brain Mapping等期刊发表论文5篇,以共同作者的身份在the Journal of neuroscience等主流SCI期刊发表论文8篇。参与开发了“弥散磁共振人脑图像的并行处理平台”(软件著作权登记号:2011SR091748;参与者),该软件的相关论文目前已被引用100余次。 PANDA软件工具包已在国际神经影像工具共享平台上(http://www.nitrc.org/projects/panda)被下载16000余次,被国内外同行广泛使用,得到了非常好的反馈和评价。
李伟凯,博士生,南京航空航天大学模式识别与神经计算研究所。主要研究方向为机器学习及脑网络构建,迁移学习。熟练掌握扩散磁共振成像领域的方法,精通相关fmri数据处理软件的操作使用。目前,已发表多篇学术论文,其中SCI论文(2区)2篇。
龙治良,博士,西南大学,讲师。具有应用数学(本科,硕士)和生物医学工程(博士)交叉学科背景。研究方向为基于多模态脑网络水平的脑疾病病理机制研究。在英国牛津大学做访问学者一年。目前参与多项国家自然科学基金项目,发表学术论文10余篇,第一作者论文5篇,包括Movement Disorders,Scientific Report。论文被引537次(google scholar)。擅长脑形态学分析、功能连接分析和脑网络分析。


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